Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APCDD1LQ8NCL9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms