Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AVL9Q8NBF6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AVL9Q8NBF6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms