Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT2Q8N9I0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT2Q8N9I0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms