Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASSF3Q86WH2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms