Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms