Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED13LQ71F56 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED13LQ71F56 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms