Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms