Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms