Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms