Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms