Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFRF1Q6IPR1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFRF1Q6IPR1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms