Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms