Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms