Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PXDC1Q5TGL8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms