Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HP1BP3Q5SSJ5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms