Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FFAR4Q5NUL3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FFAR4Q5NUL3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms