Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGD3Q5JSP0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms