Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms