Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms