Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP100Q494V2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP100Q494V2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms