Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms