Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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