Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF4Q2M2E3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms