Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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