Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYPL1Q16563 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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