Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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