Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MED1Q15648 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MED1Q15648 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MED1Q15648 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED1Q15648 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED1Q15648 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED1Q15648 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MED1Q15648 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MED1Q15648 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MED1Q15648 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MED1Q15648 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED1Q15648 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED1Q15648 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MED1Q15648 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms