Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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