Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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