Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD3Q15054 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms