Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERC3Q15034 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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