Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 IPO4-206ENST00000558718 554 ntTSL 212.67□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -11e-7■■■■■ 36.9
EFTUD2Q15029 FGFR1OP-203ENST00000476078 682 ntTSL 320.56■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SELENOW-205ENST00000598083 546 ntTSL 317.12■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SELENOW-207ENST00000598956 1032 ntTSL 212.51□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SELENOW-203ENST00000595509 675 ntTSL 310.73□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SELENOW-214ENST00000601937 674 ntTSL 29.48□□□□□ -0.891e-10■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-204ENST00000440083 1034 ntTSL 214.71□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-209ENST00000480217 509 ntTSL 514.59□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-208ENST00000477806 957 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-214ENST00000543048 571 ntTSL 59.19□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 23.54□□□□□ -1.848e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.978e-7■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 LENG8-205ENST00000439657 1073 ntTSL 512.8□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 RIT1-204ENST00000462687 548 ntTSL 310.25□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 TSEN54-209ENST00000583454 733 ntTSL 323.91■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 DVL2-208ENST00000575086 900 ntTSL 321.16■□□□□ 0.983e-10■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 DVL2-213ENST00000576840 941 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-10■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 518.77■□□□□ 0.66e-9■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 CDK5RAP2-218ENST00000491334 546 ntTSL 217.71■□□□□ 0.436e-9■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 212.39□□□□□ -0.436e-11■■■■■ 36.8
EFTUD2Q15029 DIP2A-210ENST00000480553 1906 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 PIEZO1-215ENST00000566414 564 ntTSL 416.47■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 MAGED2-210ENST00000487463 376 ntTSL 27.64□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 HSPA8-213ENST00000530391 648 ntTSL 319.13■□□□□ 0.656e-14■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 FBRSL1-202ENST00000536075 208 ntTSL 513.61□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 AKAP1-209ENST00000572560 442 ntTSL 314.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 ALDOA-220ENST00000566846 512 ntTSL 211.42□□□□□ -0.582e-13■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 310.8□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 ALDOA-210ENST00000563987 586 ntTSL 210.1□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 RPS2-216ENST00000534461 734 ntTSL 217.11■□□□□ 0.334e-17■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 HDAC3-205ENST00000469550 1952 ntTSL 1 (best)9.92□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 36.7
EFTUD2Q15029 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-12■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PPP2R3B-203ENST00000445792 1998 ntTSL 227■■□□□ 1.914e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 SMS-203ENST00000457085 931 ntTSL 524.16■■□□□ 1.467e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.187e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHLDB3-203ENST00000595498 1526 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.027e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 521.09■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-212ENST00000496443 2094 ntTSL 221■□□□□ 0.957e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ZNF496-205ENST00000478225 1007 ntTSL 220.64■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 KANTR-201ENST00000366185 1063 ntTSL 320.43■□□□□ 0.867e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-217ENST00000494483 559 ntTSL 220.3■□□□□ 0.847e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 EHMT1-217ENST00000494249 2038 ntTSL 1 (best)20.07■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 RPLP1-204ENST00000488122 940 ntTSL 220.06■□□□□ 0.83e-14■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ZNF496-204ENST00000477903 907 ntTSL 320.03■□□□□ 0.87e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.787e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 KANTR-205ENST00000605526 489 ntTSL 419.85■□□□□ 0.777e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.757e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.757e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-208ENST00000475696 1513 ntTSL 218.92■□□□□ 0.627e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.617e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-218ENST00000497915 580 ntTSL 418.7■□□□□ 0.587e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-206ENST00000462782 561 ntTSL 218.6■□□□□ 0.577e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BTRC-206ENST00000475200 527 ntTSL 318.59■□□□□ 0.577e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 SORBS3-208ENST00000520207 576 ntTSL 218.43■□□□□ 0.547e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PLCD3-209ENST00000611986 591 ntTSL 518.13■□□□□ 0.497e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 218.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TSGA10-216ENST00000489926 588 ntTSL 418.02■□□□□ 0.487e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CBX6-203ENST00000469420 2213 ntTSL 217.86■□□□□ 0.457e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.417e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHLDB3-208ENST00000600660 696 ntTSL 317.46■□□□□ 0.397e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TRMT1-223ENST00000593257 408 ntTSL 417.08■□□□□ 0.327e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 DXO-204ENST00000460058 737 ntTSL 216.98■□□□□ 0.317e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 216.92■□□□□ 0.37e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-211ENST00000442837 780 ntTSL 516.83■□□□□ 0.287e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 DXO-211ENST00000487914 1016 ntTSL 516.77■□□□□ 0.287e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-204ENST00000412476 1811 ntTSL 216.56■□□□□ 0.247e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.237e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ARPC4-207ENST00000485273 577 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-13■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 KANTR-204ENST00000604849 1196 ntTSL 516.26■□□□□ 0.197e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 TYK2-213ENST00000529739 842 ntTSL 216.25■□□□□ 0.197e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 KMT2D-207ENST00000552391 860 ntTSL 515.56■□□□□ 0.087e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PLCD3-210ENST00000615898 288 ntTSL 315.33■□□□□ 0.047e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.047e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 STK16-209ENST00000478018 1930 ntTSL 214.97□□□□□ -0.017e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.047e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 PHLDB3-204ENST00000596141 366 ntTSL 314.64□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 ZXDC-203ENST00000514463 4639 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.087e-10■■■■■ 36.6
EFTUD2Q15029 DPH7-212ENST00000485189 797 ntTSL 314.57□□□□□ -0.081e-11■■■■■ 36.6
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