Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB39AQ14964 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms