Protein–RNA interactions for Protein: Q14847

LASP1, LIM and SH3 domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LASP1Q14847 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LASP1Q14847 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LASP1Q14847 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms