Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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