Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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