Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGA9Q13797 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA9Q13797 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms