Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR4Q13639 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms