Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD1Q13562 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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