Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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