Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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