Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PMS2P3Q13401 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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