Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE3BQ13370 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE3BQ13370 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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