Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF1Q13351 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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