Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RIGQ13278 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIGQ13278 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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