Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD2Q13200 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD2Q13200 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms