Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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IFT88Q13099 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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IFT88Q13099 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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