Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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BNIP1Q12981 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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