Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms