Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms